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The map of the influenza H1N1, at 15-August-2009. The american nursery and the trail of the Monsoon.

click in the map to enlarge

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Ojo, amigos. You can read a translation in spanish of this post in this fantastic spanish site as well:

http://cnho.wordpress.com/2009/08/15/el-mapa-de-la-gripe-ah1n1-a-15-de-agosto-de-2009-el-vivero-americano-y-la-estela-del-monzon/

Well, this is the present situation of the distribution of the deceases. The data are from the spanish wiki, she updates them in real time, occasionally even several times a day, taking as source the press news by countries.

http://es.wikipedia.org/wiki/Pandemia_de_gripe_A_(H1N1)_de_2009

And this is the only way. The boycott of the majority of the countries to the WHO (by means of not giving their data) is reaching kafkian levels. The last thing I found there was this map that only can be described as “a map of the gap”.

http://www.who.int/csr/don/Global_geographicSpreadH1N1A_week31.png

And this is logically a big mistake, specially now in holiday, when the people moves most. It’s very important to know the risk levels existing in each zone. Not to cancel the travels (It’s not that bad), but for maximizing the preemptive measures, which are really simple:

 http://www.publico.es/espana/actualidad/244418/decalogo/prevenir/nueva/gripe

In Spain, from the 11 deceases, 4 were in the Comunidad Valenciana, 2 in Gran Canaria, 2 in Madrid, 1 in Baleares, 1 in Albacete and 1 in Gerona. Not disposable anything else data, we must suppose these are the zones with most risk. Take some precautions if you are here. 😉

And in the rest of the world… well, right now the worst continues being in the american continent which is acting as the true nursery of the disease. I put here the present table of deceases by countries:

list5

As you can see, from the 2.279 deceases, more of the half right now are concentrated in only 3 countries: United States, Argentina and Brazil.

The causes for this american fondness are varied. On the one hand the influenza was born in Mexico and spread faster in the near countries. On the other hand South America is located for the most part at the south of the Equator, where we are now in the Austral Winter. And finally in many countries is noticeable the lack of means or the political indolence.

They were specially striking the cases of  Argentina (where the burst of the influenza was hidden because it coincided with the election campaign) and the United States (where if you have not a private health insurance, you must pay to receive any treatment). We would desire that Obama is lucky with his public health reform, because in the present (and previous) state it’s not a normal thing that the country with the most means of the world has the most number of  deaths as well. Especially if we compare the United States with Mexico, where the influenza was contained with an obvious lower cost in human lifes.

In the table I included also a percentage with the percent increase in the number of deaths for the last 15 days. The growths more worrying in the zone are the corresponding to Brazil y Peru. There the influenza lifted off later, but it´s at its very peak right now.

And out of America, the good thing is that the influenza is being contained in Europe. Really we expect the stronger attack here for September/October, but it´s encouraging that the number of deaths continues keeping in so low parameters. The only exception is the United Kingdom, where the intensive air traffic of travelers with the United States is taking its cost.

The bad thing is that the influenza has spread quite a lot in the South of Asia in the last 15 days. It was the Monsoon. The rainy season is creating the conditions for the extension of the virus, in the same way that it does so with the common flu. Thailand and Malaysia are the main focus right now, but the influenza is starting to spread very fast in India as well.

Bad thing, if we consider the lack of sanitary infrastructures in the country. Ah well, here in Europe just in case we continue getting ready for the menace that can came in the Autumn…

http://www.publico.es/internacional/244459/alerta/pandemia/mundial

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El mapa del sida en 2007. Irracionalidad y análisis de consecuencias.

sidabrut2

En el 2.007 el sida segó la vida de aproximadamente 2,1 millones de personas.

En el mapa de arriba sólo hemos coloreado los países que registraron más de 50.000 muertes en ese año. Y lo hemos hecho con el fin de resaltar una desagradable realidad. La inmensa mayoría de las defunciones se dan en el continente africano, ligadas a la pobreza y a la falta de medios. Pero hay 2 países en el mundo que marcan un hecho diferencial: India y Sudáfrica.

En el 2.007 casi 1 de cada 3 personas que falleció en el mundo a causa del sida lo hizo en esos 2 países marcados en rojo. Sudáfrica tiene el record absoluto: 350.000 muertes en un año. La cifra que hemos puesto para India, 300.000 es muy estimativa, y sólo refleja un orden de magnitud porque no hay disponibles datos exactos. Pero en cualquier caso ambos países están muy lejos del tercero en este siniestro ranking, que es Nigeria, con 170.000 muertes en ese año.

En la tabla adjunta, extraída a partir de los datos de los informes de la Organización Mundial de la Salud (http://www.who.int/en/) se puede apreciar la abismal diferencia que existe entre las cifras absolutas de muertes en estos 2 países y los del resto del mundo:

Lista1

¿Qué es lo que hace que India y Sudáfrica sean tan distintas del resto? No son los países más pobres de esa tabla, ni aparentemente tienen mucho en común. Para el caso de India se podría alegar su inmensa población como factor, pero no para Sudáfrica. ¿Existe algún nexo que explique esta diferencia con el resto de países?

Desgraciadamente, sí, existe.

India y Sudáfrica tienen el dudoso honor de haber sido los dos únicos países del mundo donde desde instancias oficiales se ha fomentado la pseudociencia como alternativa para luchar contra la enfermedad. Y son los únicos 2 países del mundo donde fue ampliamente difundida entre la población la “teoría” de que el sida no era una enfermedad contagiosa causada por un virus sino que era consecuencia de factores ambientales.

En el caso de la India, los pseudocientíficos que recomendaban abandonar los tratamientos de la efermedad con antirretrovirales organizaron un sonado “congreso de reevaluación del Sida” en el año 2.000 con apoyo oficial y amplia cobertura mediática.

http://free-news.org/pphilp07.htm

Sudáfrica fue aún más lejos. En el caso de Sudáfrica, fue el propio presidente del país, Thabo Mbeki (elegido en 1.999) el que se puso al frente de las teorías “heterodoxas” afirmando que el sida era causado por la pobreza y que los antirretrovirales eran contraproducentes y sólo causaban más enfermedad.

http://es.wikipedia.org/wiki/Thabo_Mbeki

 http://pravda-truth.blogspot.com/

Bien. Ahora vamos a ampliar un poco el mapa de arriba para ver en detalle las consecuencias:

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Nótese que el mapa refleja el número de muertos por sida en 2.007. Si hubiera sido un mapa de prevalencia del virus, los pseudocientíficos alegarían que no tiene importancia, porque el virus no causa la enfermedad (!), pero los muertos no se pueden discutir. Son lo que llamamos un hecho. En este caso macabro.

Llegados a estas alturas del post, seguro que más de alguno pensará que por qué tanto énfasis si hoy día ya no queda nadie que defienda que el sida no es una enfermedad contagiosa. Bueno, en el tercer mundo no. Allí los que pensaban eso ya han muerto. Pero en este primer mundo la pseudociencia y la magufada tienen un rincon privilegiado en Internet. Os invito a que googleéis Sida+fraude y veréis como rápidamente aparecen cientos de páginas que siguen insistiendo irracionalmente en que el sida no está causado por ningún virús y no es contagioso.

En realidad es muy fácil. Sólo basta con poseer una incultura a prueba de bomba, acceso a un ordenador, y… muchas ganas de ser el listo de turno que lo sabe todo sobre todo y le da mil vueltas a esos científicos tan pesados porque, a diferencia de ellos, nuestro anónimo transgresor tiene la mente “avierta”.

El problema es que ese tipo de ideas se generan en nuestro cómodo primer mundo, pero jamás se aplican en él. Aquí si alguien cae enfermo, por muy “avierta” que tenga la mente, suele cumplir escrupulosamente lo que le dicen los médicos. No hay nada como el miedo.

Pero en el tercer mundo, que es el destinatario experimental de tan “aviertas” ideas al ser el único sitio del planeta donde un dirigente loco puede llevarlas a cabo sin ser cuestionado, allí los muertos se pueden ir acumulando sin que aquí notemos que ocurra nada extraño.

En fin. Las cifras absolutas cantan por sí solas, pero por ampliar información, podemos ver el mapa con las tasas de mortalidad por sida superiores a un 1 por mil por países:

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Este es más fácil. Cómo todas están en Africa, se puede ampliar mejor:

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Y también se puede apreciar mejor el problema en toda su magnitud. El país con mayor tasa de fallecimientos por sida en el mundo es Zimbawe, que parece estar empeñado en su particular suicidio colectivo a nivel político y social (dictadura, destrucción de la economía del país, trabas a la acción humanitaria, aislamiento internacional, etc).

Inmediatamente detrás de Zimbawe vienen Sudáfrica y sus estados-satélites Lesotho y Swazilandia. La tasa de mortalidad se va reduciendo según nos alejamos de este epicentro.

Y lo siguiente es otra tabla comparativa de la tasa de mortalidad sudafricana con el resto de países:

Lista2

Las cifras cantan por sí solas. En fin. El contexto africano es ya de por sí lo suficientemente jodido por la pobreza, la falta de medios y la ausencia de estructuras sanitarias. Si en lugar de contribuir a sacarles adelante mediante las ONGs y la investigación, lo que hacemos desde Occidente es lanzarles magufadas y mensajes confusos sobre la enfermedad por Internet, es normal que la cosa termine en genocidio. Incluso en países que a priori no son de los más pobres o con menos medios precisamente, como es el caso de Sudáfrica. ¿Quién es el auténtico responsable?

El sida no tiene cura, pero sí puede ser contenido (aumentando cada vez más la esperanza de vida de los infectados gracias a los antirretrovirales), y sobre todo prevenido (especialmente en las vías de contagio sexual).

Las gráficas de la evolución por países dan una idea del impacto de los antirretrovirales en Occidente:

USA

Curioso pico en el año 1995, cuando se empezaron a aplicar los antirretrovirales inhibidores de la proteasa y los inhibidores de la transcriptasa en modo combinado.

Alemania

El efecto en Europa fue inmediato. ¿Y en España?

España

Pues también. 😉  El problema, como siempre, en el tercer mundo, donde el uso de antirretrovirales por motivos económicos no se ha empezado a generalizar hasta hace muy pocos años. El 2.007 ha sido un año muy bueno en ese sentido:

Etiopia

Vaya con Etiopía. Aunque tardía, no está mal la reacción para ser uno de los países más pobres de Africa. 😉

Tailandia

Y en Tailandia lo fundamental fue la política de prevención de contagios por vía sexual. Funcionó.

Tanzania

Y en Tanzania la enfermedad también ha cedido recientemente.

Nigeria

Incluso en Nigeria está cediendo, con algún que otro esfuerzo.

Sudafrica

El gráfico de Sudáfrica no está a la misma escala que la mayoría. Si lo estuviera, dejaría empequeñecidos a todos los demás. La política del país ha cambiado bastante en los últimos dos años, pero ¿cuantos años más serán necesarios para remediar el desaste?

Estamos hablando de seres humanos, no sólo de cifras en un gráfico. Y es por eso por lo que yo exigiría a las personas de “mente avierta” que cuestionan a la comunidad cientifica internacional desde su cómoda butaca del salón para plantear teorías “heterodoxas”, a ellos les exigiría que, antes de soltar la becerrada correspondiente en el post se plantearan algo tan simple, tan lógico y tan humano como un análisis de consecuencias.

Mapeando la gripe A/H1N1 de nuevo.

Gripe A-31Mayo

Mapa de casos confirmados de gripe A/H1N1 en España con origen en la academia militar de Hoyo de Manzanares, que muestra el rebrote de la enfermedad producido en la última semana de Mayo.

¿por qué vienen en el mapa sólo los casos relacionados con Hoyo?

Porque desde el 15 de Mayo el Ministerio de Sanidad no ha vuelto a ofrecer datos de la distribución acumulada de los casos por provincias o comunidades. En esa fecha el número de casos confirmados en España era de 103.

Sin datos es imposible hacer mapas, claro (ni saber lo que está pasando). En todo caso la epidemia parecía bastante controlada hasta que estalló el nuevo brote en la academia militar de Hoyo de Manzanares (Madrid) el 22 de Mayo.

El mapa de arriba sólo recoge los casos aparecidos en la última semana de Mayo cuyo origen está relacionado con ese cuartel. A 31 de Mayo eran 49 casos confirmados. Y el total de casos confirmados en España de 167 (según cifras de la Unión Europea, porque no hay información directa del Ministerio).

A la vista del mapa parece claro que la situación a día de hoy parece lejos de estar controlada. Aunque también está claro que es imposible hacer el seguimiento de un problema (y no digamos afrontarlo) cuando hay unas elecciones cercanas.  😦

Para compensar, hay un bonito mapa interactivo con la evolución de los casos en Europa, en la página web de la World Health Organization:

gripe interactivo

http://data.euro.who.int/maps/ah1n1/index.html?filter=filter5,confirmed%20cases

El mapa ofrece unas significativas gráficas de crecimiento por países. La línea rosa indica el número total de casos acumulados en Europa,  y la línea azul el número de casos de cada país en concreto. Lo bueno de la gráfica es que expresa muy bien la evolución de la enferdad día a día y por países, aunque la línea de España es engañosa, porque no está dibujada con datos actualizados.

De todos modos, cliqueando en el mapa se puede ver rápidamente que el principal causante del crecimiento de casos en Europa en la última semana es el Reino Unido. Y a priori la causa principal parece clara: el tráfico con Estados Unidos, donde la enfermedad parece que sigue completamente fuera de control.

Y por último, os dejo otro curioso mapa provincial a nivel del continente americano, elaborado por la Organización Panamericana de la Salud:

gripe america

 

Este me gusta especialmente, porque refleja unas diferencias regionales muy significativas, que no se suelen apreciar en los mapas continentales por países. No hay más que ver la enorme diferencia de casos entre Terranova y Ontario, o entre Virginia Occidental y Texas.

Seguiremos mapeando, croacs! 😉

El mapa genético del pollo campero.

Mapa_de_un_gen_B-G_del_CMH_en_pollos

Mapa por cortesía de la doctora Gabriela Iglesias, Universidad de Buenos Aires.  Este no lo podéis difundir sin poner la fuente. 😉

Pues sí señor, aunque no lo parezca esto es el mapa de un pollo. Bueno, de un cacho de pollo. Concretamente de un gen B-G o gen de clase IV del Complejo Mayor de Histocompatibilidad.

Pero antes de nada, presentemos al pollo, porque es un tipo curioso.

El pollo campero es algo así como un superhéroe creado por un grupo de científicos locos dirigidos por el ingeniero Bonino en la Estación Experimental Pergamino. Para crear a nuestro héroe fueron necesarios meticulosos cruzamientos de gallinas asiáticas caracterizadas por su sabrosa carne, ya que el objetivo de estos científicos locos no era dominar el mundo, sino algo mucho más complicado: alimentarlo.

Y de este modo, siguiendo el método tradicional de cruzamientos  y sin ninguna ingeniería (nuestro pollo no es transgénico) obtuvieron un tipo ecológico, resistente, y con una carne con menos grasa y mejor textura y sabor que la del pollo comercial clásico. Ideal para la avicultura tradicional en un entorno de producción sostenible.

El pollo Campero ha sido ya testado en Francia por los más exigentes paladares, y el proceso de investigación para su mejora genética continúa hoy día con resultados alentadores. Y por lo que veo en la web de la UBA muchas veces a base de investigaciones “sin financiación”, lo cual demuestra que estos científicos están definitivamente locos…

Pero ahora, pasemos a ver el mapa.

El área mapeada pertenece al Complejo Mayor de Histocompatibilidad, que es un área geográfica existente en todos los genomas de los animales vertebrados. En este área se encuentran los genes implicados en la identificación y respuesta del sistema inmune ante un elemento extraño, y más específicamente en el modo en que un linfocito reconoce a bacterias y virus como enemigos. Es también un área importante de cara a investigaciones sobre transplantes o cáncer.

Dentro del CMH hay una zona genética, la B-G (=clase IV) que es la del gen mapeado. Esta zona es particularmente interesante, porque es propia de las aves pero no se da en los mamíferos. Su función no está del todo clara y hay gran número de polimorfismos (variaciones en la secuencia distintas en cada individuo). Terreno inexplorado lleno de interrogantes y donde es complicado avanzar.

El gen cartografiado está delimitado a ambos lados por los típicos “untranslate region” y aparece dividido en un mosaico de exones distinguidos por sus llamativos colores. Los exones son las secuencias de bases que contienen el material codificante del gen. Los intrones de color blanco que aparecen intercalados entre ellos son las secuencias de bases que no codifican (lo cual no quiere decir necesariamente que no trabajen, ya que a veces su presencia puede dar lugar a un tipo diferente de proteina).

El exon 2, con un tamaño de 341bp, es el más tocho. El resto de la secuencia codificante está muy fragmentada en una interminable sucesión de exones pequeñitos. Como siempre, esto nos puede indicar dos cosas, o bien una larga e interesante historia evolutiva a nivel molecular, o bien que el genoma fue diseñado por un tipo cachondo que estaba de broma ese día.

Sobre la proteína codificada y muchas otras cosas más podéis preguntarle a la autora directamente en su blog:

http://genmolecular.wordpress.com/web

PD: Si hay algún error en el texto, avísame, Gaby, que en muchos temas de genética ando un poco cortito… 😉

La gripe A/H1N1 en España a 8 de Mayo de 2009

Gripe A-08Mayo_jpg

Bueno, este es el último mapa con los datos de ayer viernes por la tarde. Parece que la cosa se va estabilizando. Desde hace unos días los únicos nuevos casos son en Sevilla, Barcelona y Valencia. Y cada vez son menos.

Aquí he puesto también una gráfica con la evolución. Parece que estamos alcanzando ya la curva de inflexión:

Cuadro_gripe_jpg

Y para los coleccionistas de cromos, también van los mapas de ayer y anteayer:

http://img151.imageshack.us/img151/5484/gripea06mayo.png

http://img151.imageshack.us/img151/3549/gripea07mayo.png

Pero el mapa más preocupante en este momento es el de la OMS con la distribución mundial, y especialmente en América. Allí no está siendo nada fácil contener la epidemia:

http://www.who.int/csr/don/GlobalSubnationalMaster_20090509_0805.jpg

La gripe A/H1N1 en España a 5 de Mayo de 2009

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Bueno, aquí está otro mapa actualizado con los datos de ayer martes por la tarde.  Para verlo en grande, click ratón derecho y abrir en otra pestaña, como siempre.

Curiosamente el principal foco provincial (Valencia) se corresponde con la menor información local disponible. Como si no haciendo públicos los datos pudieran contener la gripe. En fin. Supongo (sólo supongo) que los 19 casos están en el hospital de la Fe (Valencia), pero no sé si hay alguno en el de san Juan (Alicante) o en otro lugar de la comunidad.

PD: Para los insaciables, os pongo la colección completa por días:

http://img124.imageshack.us/img124/5102/gripea05mayobmp.png

http://img523.imageshack.us/img523/6932/gripea04mayo.png

http://img259.imageshack.us/img259/4471/gripea03mayo.png

http://img141.imageshack.us/img141/8470/gripea02mayo.png

http://img141.imageshack.us/img141/5216/gripea01mayo.png

http://img204.imageshack.us/img204/879/gripea30abril.png

http://img204.imageshack.us/img204/4202/gripea29abril.png

http://img204.imageshack.us/img204/5141/gripea28abril.png

http://img204.imageshack.us/img204/9170/gripea27abril.png

La gripe A/H1N1 en España a 4 de Mayo de 2009

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Bueno, a simple vista este no parece un mapa muy raro, pero lo es, lo es. Es el primero que veo con una distribución provincial, y para verlo lo he tenido que hacer yo mismo, claro. Diríase que casi es un ejemplar de coleccionista.

 🙂

El ministerio de sanidad actualiza los datos por comunidades una o dos veces al día. Pero no hay datos a nivel provincial en ninguna parte (con la única excepción de la Junta de Andalucía, que sí los ofrece). Y menos aún a nivel local.

De hecho el mapa lo he realizado a partir de recortes de la prensa local, no siempre fiables, claro, pero espero que si hay algún error será pequeño (y espero que me lo indiquéis para corregirlo).

No sé, pero al entrar al detalle de las páginas de las comunidades autónomas que enlaza el ministerio de sanidad, la mayoría no dicen nada (como mucho alguna página de consideraciones generales).

Hay muy pocos comunicados de prensa a nivel de autonomías, y los que hay dicen poco sobre lo que está pasando. Es como si se hubiera instalado un miedo absurdo a informar (cosa frecuente en los políticos de cualquier pelaje).

Y evidentemente para luchar contra cualquier problema, el primer paso es estudiarlo y conocerlo. Negar que existe (o que no ha llegado a mi pueblo) no lleva a ninguna parte. Por eso ahí os dejo el mapa, para ver y difundir.

Es freeware. Croacs!